Esta sorprendente aventura se resume en una historia animada envuelta en una fresca comedia, en ella dos chicos muy traviesos: Jorge y Berto quienes son muy buenos amigos, viven obsesionados con los comics, siendo este el principal motivo por el cual siempre deciden pasar el día dibujando sus propias tiras cómicas, así como hacer bromas, en su mayoría, pesadas. Sin embargo, un día cuando el Director de la escuela, un especialista en acabar con todo tipo de diversión, cansado por sus constantes bromas decide separarlos de curso, pero de forma accidental logran hipnotizarlo, convirtiéndolo en el súper héroe de sus tiras cómicas, El Capitán Calzoncillos; trajeado con un calzoncillo y su capa realiza las más alocadas incursiones heroicas. Sus poderes provienen de su turbo calzoncillo, y resalta por obtener su identidad de superhéroe cada vez que alguien chasquea los dedos, pero extrañamente pierde su poder cuando recibe un poco o gran cantidad de agua sobre él, volviendo a ser nuevamente el Sr. Carrasquilla.
Mientras el director asume su nuevo rol de superhéroe, a la escuela llega encubierto de maestro un malvado científico que quiere vengarse desde la escuela. Jorge, Berto y el Capitán Calzoncillos tendrán que unirse para frustrar el malvado plan del científico maestro.
